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乙型Yamagata流感病毒（By）检测试剂盒（实时荧光PCR法）

将PCR反应所需的成分配置完后，在PCR仪上于94-96℃预加热几十秒至几分钟，使模板DNA充分变性，然后进入扩增循环。在每一个循环中，先于94℃保持30秒钟使模板变性，然后将温度降到复性温度（一般50-60℃之间），一般保持30秒钟，使引物与模板充分退火；在72℃保持1分钟（扩增1kb片段），使引物在模板上延伸，合成DNA，完成一个循环。重复这样的循环25～35次，使扩增的DNA片段大量累积。*后，在72℃保持3-7min，使产物延伸完整，4℃保存。
1．常规程序

2．复性（退火）和延伸温度

复性的温度是PCR扩增是否顺利的关键因素，通常在50-60℃之间。具体的温度主要由引物的Tm值决定。延伸温度绝大多数设定为72℃。如果复性的温度很高，可以将延伸温度和复性温度设置成同一温度，变成二步法PCR。

3．反应时间

变性步骤一般使用30秒钟，如果模板的G+C含量较高，或直接用细胞做模板，变性时间可适当延长。复性时间有30秒种一般是足够的。延伸时间由扩增产物的大小决定，一般采用1kb用1分钟来保证充足的时间。

4．循环次数

循环次数主要与模板的起始数量有关，在模板拷贝数为104～105数量级时，循环数通常为25～35次。

平台效应（plateaueffect）：PCR扩增过程后期会出现的产物的积累按减弱的指数速率增长的现象。原因：底物和引物的浓度已经降低，dNTP和DNA聚合酶的稳定性或活性降低，产生的焦磷酸会出现末端产物抑制作用，非特异性产物或引物的二聚体出现非特异性竞争作用，扩增产物自身复性，高浓度扩增产物变性不彻底。

5．PCR反应液的配制

PCR反应体系的配置方式有时也会影响反应的正常进行。常规方法与其它酶学反应一样，在*后加入DNA聚合酶。早期的PCR仪没有带加热的盖子，要求在反应液上覆盖一层矿物油，防止水分蒸发。

对于使用具3’-5’外切活性的高温DNA聚合酶时，有时会扩增不出产物。在遇到这个问题时，如果将反应成分分开配制，A管含模板、引物和dNTP，以及调整体积的H2O，B管含缓冲液、DNA聚合酶和水，然后再将两管溶液混合起来，可较好地克服这个问题。

按照常规的方法配制反应体系，有时会出现非特异性扩增的问题。热启动（hotstart）PCR操作方式可较好解决这一问题。将dNTP、缓冲液，Mg2+和primer先配制好，然后加入一粒蜡珠（如AmpliWaxPCRQam100），加热熔化，再冷却，使蜡将溶液封住，*后加入模板和DNA聚合酶等剩余成分。只有当PCR反应进入高温阶段后，蜡层熔化，所有反应成分才会混合在一起。

乙型Yamagata流感病毒（By）检测试剂盒（实时荧光PCR法）

【使用方法】

1. 样品处理（样本处理区）

1.1 样本前处理

组织：取50mg左右组织用玻璃匀浆器匀浆，匀浆后置入洁净的1.5ml离心管中；
液体标本：取适量标本13000rpm离心2min，弃上清。
1.2 DNA提取

1) 对上述处理好的标本加入40ul 核酸提取液，100℃恒温处理10分钟，13,000 rpm离心5分钟，取上清液转移至新的1.5ml EP管，-20℃保存；

2) DNA的提取也可以采用北京亿森宝公司生产的DNA提取试剂盒（离心柱提取法），请严格按照试剂盒说明书进行操作。

2. 试剂配制（试剂准备区）

根据代检测样本总数，设所需要的PCR反应管管数为N（N=样本数+1

管阴性对照+1管阳性对照），体系配制如下表：

试剂

WSSV 反应液

酶液

用量（样本数为N）

20μl

1μl

3. 加样（样本处理区）

将步骤1提取的DNA、阳性质控品、阴性质控品各取4μl，加入相应的

反应管中，盖好管盖，混匀，短暂离心。

4. PCR扩增（核酸扩增区）

4.1 将待检测反应管置于荧光定量PCR仪反应槽内；

5. 结果分析判定

结果分析条件设定
设置基线（baseline）：一般情况下，对ABI 7500、7700等仪器设为6-15cycle，对PE5700设为3-15cycle,对MJ Research Option2设为6-12cycle。特殊情况可对基线适当调整。
设置阈值（threshold）:以阈值线刚超过阴性对照扩增曲线（无规则的噪音线）的zui高点。
结果判断
阳性：检测样本Ct值小于等于35.0，且曲线有明显的指数增长期；
可疑：检测样本Ct值大于35.0且小于40.0，重复一次实验，如果Ct值仍小于40.0，且曲线有明显的指数增长期，为阳性，否则为阴性；
阴性：检测不到样本Ct值或Ct值为40。
6. 对检验结果的解析

实验室环境污染，试剂污染，标本交叉污染会出现假阳性结果；试剂运输，保存不当或试剂配制不准确引起的试剂检测效能下降，出现假阴性或定量检测不准确的结果。

7. 质控标准

阴性质控品：扩增曲线无对数生长期或无Ct值显示；
阳性质控品：扩增曲线有明显对数生长期，且Ct值≤32;
以上条件应同时满足，否则实验视为无效。

乙型Yamagata流感病毒（By）检测试剂盒（实时荧光PCR法）需要自备的器材： 

1．仪器：分析天平、离心机、荧光 PCR 扩增仪、组织研磨器、-20 ℃冰箱、可调移液器（2 μL、20μL、200 μL、1000 μL）。

2．耗材：荧光 PCR 专用反应管、眼科剪、眼科镊、生理盐水、1.5 mL 经焦碳酸二乙酯（DEPC）水处理的灭菌离心管、吸头（10 μL、200 μL、1000 μL）、灭菌双蒸水。